Bazylika św. Agnieszki i św. Jakuba Nysa (opolskie)

Pierwsze organy, będące dziełem nieznanego mistrza, naprawiał w roku 1548 słynny organmistrz Simon Faber, a użyty przy tej okazji zwrot die grosse Orgel sugeruje, że już wtedy w kościele istniały dwa instrumenty, zgodnie z częstą wówczas praktyką. Simon Faber w roku 1556 zbudował także małe organy.

Duży instrument remontowany przez Simona Fabera miał aż 36 głosów w trzech manuałach i pedale 15 miechów, a wszystkie piszczałki (prócz głosu Höltzerner-Bass w pedale) wykonane były z metalu. Zaliczany był do najwspanialszych niemieckich organów. Mały instrument nad zakrystią miał 18 głosów w dwóch manuałach i pedale. W kościele znajdował się ponadto 8-głosowy pozyty.

Od schyłku XIX wieku organami nyskiej bazyliki opiekowała się miejscowa firma organmistrzowska Paula Berschdorfa (1859-1933) i jego syna, Carla (1887-1950). Po nauce u ojca Carl terminował u Augusta Laukhuffa w Weikersheim i z tego właśnie warsztatu pochodzą głosy języczkowe dzisiejszych organów. Berschdorfowie zmienili trakturę instrumentu Kretschmera z mechanicznej na pneumatyczną, zgodnie z ówczesną praktyką. Zmniejszyli także liczbę głosów tak, że bezpośrednio przed wojną organy liczyły 46 głosów, w tym znakomite głosy fletowe oraz języczkowe. Organy spłonęły w roku 1945 wraz z bogatym archiwum muzycznym kościoła, które znajdowało się na tzw. chórze mieszczańskim. Zachowały się jedynie nieliczne zdjęcia dawnego instrumentu, a szczątki starych organów spoczywają w bocznych wnękach na chórze.

Po wojnie przejściowo w kościele znajdował się 18-głosowy instrument Franciszka Kandefera z 1943 r., wywieziony z Gródka Jagiellońskiego k. Lwowa. W 1969 r. trafił on ostatecznie do Baszni Dolnej (woj. podkarpackie). Obecne organy zbudowała w 1972 r. firma Aleksandry Biernackiej-Grandys.

W marcu 2019 r. przystąpiono do remontu świątyni. W tym czasie zabiezpieczono i wyłączono instrument z użytku. Po pracach związanych ze sklepieniem kościoła rozpoczęto remont organów. Dodano wówczas połączenia oktawowe. Prace przy instrumencie wykonały firmy: Vestra z Lubrzy koło Prudnika oraz T2logic. Instrument po przeprowadzonych pracach został poświęcony 25 lipca 2021 r. przez biskupa opolskiego Andrzeja Czaję.