Kościół w Gręboszowie został zbudowany w 1650 roku. Pierwsza wzmianka o organach w jego wnętrzu pochodzi z roku 1664. Instrument ten miał 12 głosów. W 1818 r. w kościele znajdowały się 18-głosowe organy wymagające naprawy. W 1859 r. staraniem proboszcza, ks. Kalatowicza, zbudowano nowy instrument. Został on zniszczony w 1915 r. w wyniku działań I wojny światowej. Metalowe pozostałości po organach zostały następnie zarekwirowane przez władze austriackie na cele wojenne.

Na nowy, istniejący dziś instrument firmy Rieger zbierano składki już w 1924 roku. Pismem z 26 lipca 1926 r. proboszcz poinformował kurię o nabyciu organów i prosił o pomoc w uzyskaniu zwolnienia
z opłat celnych (wynoszących 1260 zł) ze względu na zniszczenie poprzednich organów w czasie wojny. Nie wiemy, czy starania te zakończyły się sukcesem. W wydanym ok. 1933 r. katalogu firmy zawierającym m.in. podziękowania za zbudowane instrumenty, znalazło się także i to dotyczące organów w Gręboszowie. Brzmi ono następująco:

Monterowie, którzy montowali nasze organy, wywiązali się ze swojego obowiązku ku ogólnemu zadowoleniu wzorowo i odznaczyli się sumiennością, pilnością i przykładnem zachowaniem się. Organy przedstawiają się tak co do wewnętrznej budowy, jak i co do struktury zewnętrznej i artystycznej intonacji, jako instrument a r t y s t y c z n i e wykonany i celowi swemu odpowiadający. Z tego powodu wyrażamy firmie Bracia Rieger podziękowanie i pp. Monterom uznanie za ich pracę.

Fachowy znawca organów:
Ks. Fr. Walczyński,
infułat, dziekan kapituły z Tarnowa.
Ks. Piotr Halak,
dziekan i proboszcz w Gręboszowie

Organy były remontowane w 1950 roku, a w 1958 r. Wacław Biernacki z Krakowa zamontował dmuchawę elektryczną . W 1973 r. organy znów wymagały pewnych prac remontowych. W czasach nam bliższych instrument był naprawiany przez Kazimierza Plewę z Nowego Sącza.

Prospekt eklektyczny z elementami neoromanizmu i neorenesansu, pięcioosiowy. Stół gry wolnostojący; grający siedzi we wnęce w przedniej ścianie szafy organowej, przodem do ołtarza. Wiatrownice stożkowe.

Skala manuałów: C-f³; skala pedału: C-d¹.